崇祯二年三月，面对京城士子冲击官府的事件，朱由检出动勇卫营，以雷霆手段迅速镇压之。一时间再次引起全城轰动。

事情发酵，舆论再次哗然，不过这次大家理智了好多，还有残存的正在读书的人家，纷纷把自家孩子给关在家中，一天天跟看狗一样看着，生怕自己家也被轰了。而遭殃的那些人家，以及此次事件的罪魁祸首东林党人，则是针对此次事件，疯狂进行口诛笔伐，坚决不动手动脚…

“惊现！刽子手孙应元竟然对手无缚鸡之力的生员，士子大下杀手…”

“奇闻！对付一群生员，竟然动用大炮，到底是道德的沦丧，还是人性的扭曲…”

“刑不上大夫！众多生员公然被打杀，无数人被关天牢…礼崩乐坏…”

“他们有什么错？他们只不过是用了一种错误的手段，在错误的时间表达了正确的观点而已…”

一时间，各种文章漫天飞舞，而此时被针对的对象孙应元正在西苑大营呼呼大睡。他表示，自己的所作所为完全合法合规，并且对于对付这群乌合之众，自己提不起丝毫兴趣…

然而事情并没有结束：

东林党人在顾宪成等人的指使之下，继续将舆论风向引向阉党和厂卫身上。

朱由检则是下诏，将参与此次事件的所有人员一律定为乱党，削掉了所有参与事件人员身上的功名。并严令，彻查此次煽动士子事件，要求京兆府会同三法司，务必揪出幕后黑手，严惩不贷。

夹在中间的京兆府与三法司等一众人，至此全部戴上了痛苦面具。他们每个人都知道是怎么回事，但是朝中三分之二的官员都与此事有关联，这个案子怎么查？查到哪里算球？

而朱由检这边，也是不断地收到为京城士子求情的文书，同一时间，撤销厂卫，以及定阉党逆案的的折子也如雪片一般，从全国各地送来。

同时，企图求见天子，为学生求情的官员们，统统被朱由检挡在宫门之外，一律不见。

同样在崇祯二年三月，秦良玉带着其子马祥麟，儿媳张凤仪，以及四个侄子：参将秦佐明、参将秦祚明（秦良玉弟弟秦民屏之子，秦民屏于天启四年在在陆广战死），副将秦翼明、副将秦拱明（秦良玉大哥秦邦屏之子，秦邦屏于泰昌元年，在辽东浑河血战身死），领石柱白杆兵共计一万一千八百一十八人，日夜兼程，赶至京城。

此时，朱由检正在西苑临时办事处，与宋献策，袁枢一起处理公文。忽闻奏报：

“报…陛下，石柱土司，上柱国，左都督，镇东将军秦良玉，奉旨率军入卫京师，如今大军已至京师西城门处五里外驻军。秦将军遣将前来禀报，请陛下定夺！”