十八年后，明孝宗患上感冒，不久便紧急召集大臣交代后事，次日撒手人寰。吏部尚书马文升上书要求追查皇帝死因，调查结果显示又是刘文泰。原来他与太监张瑜关系好，成为太医院二把手。

明孝宗得病后，张瑜未走常规流程，直接找了和自己关系好的刘文泰和高廷和，不经诊断就草草开药，导致皇帝死亡。这次三人集体被判死刑，但刘文泰凭借与谢迁、李东阳的交情，死刑改判流放，最后病死在广西。

尽管刘文泰医术不精、人品欠佳，但在明孝宗打算重修医书时，他主持了这项工作。他修书不迷信古书，注重实验和疗效，将药用来源分为玉石、草、木、果等10部，共收药物1815种，还创造性地请来了8位宫廷画师绘图，绘制了1358幅精美的彩色写生图，成就了中国第一部大型彩绘图书《本草品汇精要》。此书因刘文泰治死皇帝的事件被封存，后来历经辗转，部分版本曾流入日本、罗马等，直到2002年才首次出版刊印。

大明嘉靖二十一年（公元1542年），宫女们试图勒死嘉靖帝，嘉靖帝气绝但未身亡。太医许绅奉命救治，他以一剂猛药救活了嘉靖帝。《明史》记载，许绅“急调峻药下之，辰时下药，未时忽作声”，嘉靖帝吐出淤血数升后能说话，又服下数剂猛药后逐渐痊愈。

许绅治好了皇帝的病，自己却病倒了。原来，他给皇帝用猛药是不得已而为之，这是御医的大忌，风险极高。

许绅临终前对家人说，抢救皇帝时他清楚治不好就难逃一死，因此受到惊吓，惊悸而生疾，不是药物能治愈的。没几天，许绅便惊悸而死。嘉靖帝赐谥号“恭僖”，还提拔他的一个儿子入朝为官，赏赐钱财为他治丧。

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陈君佐是元末明初着名医生，洪武初年任职太医院御医。他天性滑稽幽默，能言善辩。朱元璋常赐食物给他，并要求他说的话能令皇帝高兴。

朱元璋赐给陈君佐一碗醋，问他酒味道如何，他回答“折腹”，既说太酸肚子不舒服，又隐含“折福”的意思；朱元璋赐生牛皮给他吃，问牛肉味道怎样，他说“难消”；朱元璋赐给他一顶宽大的官帽，问他感觉如何，他说“感戴不浅”，隐含着感恩戴德的含义，朱元璋对他的回答很受用。

陈君佐曾伴朱元璋到御花园游玩，朱元璋突然让马停下来，要求他立马作诗。陈君佐思考片刻吟诵道：“君王停马要诗篇，杜甫诗中借一联。金勒马嘶芳草地，玉楼人醉杏花天。”朱元璋听后非常满意。后来陈君佐厌倦了宫廷生活，永乐年间弃官隐居在武当山卖药，做了逍遥自在的道士。

慈禧46岁时得了一场“怪病”，症状与怀孕几乎无异。第一位太医为慈禧诊脉后闭口不谈病因；第二位太医诊脉后表示这是怀孕的症状，结果被慈禧怒斩，为防止此事传开，第一位太医也一同被杀害。后来，光绪皇帝颁布诏令，寻访各地名医，一位曾是知府的民间名医被请入宫中。他诊断后说慈禧太后并非怀有身孕，而是因日夜操劳国事才患上此症，慈禧太后对这个诊断很满意。

清朝灭亡后，有侥幸存活的太医揭露，慈禧曾让太医开一些莫名其妙的药，这些药含有一定毒素，光绪皇帝的死可能与慈禧有关。在后续的考古中发现，光绪皇帝的身体中含有大量水银，意味着他生前可能中毒。

钱乙在北宋时期不仅在民间享有盛誉，也曾为皇室贵胄诊治。传闻有一次，一位皇室小王子突发急症，高热不退且抽搐不止。太医院众太医束手无策，钱乙被紧急召入宫中。